اولین تفاوت نوع سیستم عامل : سیستم عاملی که بر روی سرور لینوکس نصب شده ، لینوکس و سیستم عاملی که بر روی سرور ویندوز نصب شده ، ویندوز است .
دومین تفاوت ساپورت زبان های برنامه نویسی : سیستم عامل لینوکس زبان های برنامه نویسی ASP و .Net که شامل (C# , Visual Basic و غیره) و بانک اطلاعاتی MSSQL را ساپورت نمی کند ، اما سیستم عامل ویندوز ASP , .Net و بانک اطلاعاتی MSSQL را ساپورت می کند .
سومین تفاوت نوع وب سرور : وب سرور ویندوز IIS و وب سرور لینوکس Apache است . نرم افزار وب سرور لینوکس که معمولا آپاچی است را می توان روی ویندوز نصب کرد ، اما نرم افزار ویندوز که آی آی اس است را نمی توان روی لینوکس نصب کرد.
چهارمین تفاوت کیفیت و بهره وری : سرور لینوکس از نظر کیفیت ، ثبات ، امنیت درجه بالاتری نسبت به سرور ویندوز دارد . چون بیشتر کاربران کامپیوتراز سیستم عامل ویندوز استفاده می کنند ، این امر باعث شده تا بیشترین حملات ویروس ها برای این سیستم عامل طراحی شده باشد .
پنجمین تفاوت قیمت : هزینه خرید میزبانی وب لینوکس ارزان تر از میزبانی وب ویندوز است . چون لینوکس سیستم عامل Open Source و رایگان است و ما هنگام استفاده حق لایسنس پرداخت نمی کنیم .(البته این دلیل می تواند یکی از محاسن سیستم عامل به شمار آید) ، ولی سیستم عامل های ویندوز Open Source نیست و ما به هنگام استفاده حق لایسنس نرم افزار پرداخت می کنیم .
نکات مهمی در این مبحث وجود دارد
به هنگام استفاده از سرورهای هاست ویندوز و لینوکس ،احتیاج نیست سیستم عامل کامپیوتر شما همان سیستم عامل سرور هاست باشد .سیستم عامل کامپیوتر شما هر چه باشد ، می توانید از این دو سرور به انتخاب خود استفاده کنید .
به هنگام استفاده از سرورهای هاست ویندوز و لینوکس ،احتیاج نیست سیستم عامل بازدیدکنندگان وب سایت شما همان سیستم عامل سرور هاست شما باشد .به عنوان مثال کسی که سیستم عامل ویندوز دارد می تواند تمام وب سایت هایی که سیستم عامل سرور آنها لینوکس است را مشاهده کند و یا برعکس ، کسی که سیستم عامل لینوکس دارد می تواند تمام وب سایت هایی که سیستم عامل سرور آنها ویندوز است را مشاهده کند.
نکته کلی این است که کاربران وب سایت ها متوجه نوع سیستم عامل سرور هاست شما نخواهند شد.
به هنگام استفاده از سرورهای هاست ویندوز و لینوکس ، احتیاج نیست شما کارکردن با آنها را بدانید ، به عنوان مثال اگر شما با سیستم عامل لینوکس کارنکرده و تجربه استفاده از آن را ندارید ، می توانید از سرور هاست لینوکس استفاده کنید.